慢性肾盂肾炎的病理的表现,是肾组织活动性炎症与修复、纤维化及瘢痕形成的综合改变。因病情和病程不同,病变可累及一侧或双侧肾脏,双侧肾脏损伤程度可不相同,病变分布也不均匀,呈不规则灶性、多灶性或片状。
大体解剖可见肾包膜苍白,不易剥脱。肾外表因瘢痕收缩而凹凸不平,肾盂及肾盏扩大,肾盂肾盏黏膜及输尿管管壁增厚,肾皮质激及乳头处瘢痕形成,肾髓质变形,皮髓质分界不清,严重者肾实质管方萎缩。
光镜下肾间质可见淋巴细胞单核细胞浸润,急性发作期还可见中性粒细胞浸润,伴不多程度肾间质纤维化,大量肾小管萎缩和消失,早期肾小球相对正常,晚期肾小球荒废。