如果一个人的HLA-B27检测结果是阳性,并且有诸如慢性疼痛,炎症,x线检查提示骨骼呈退行性变的改变,那么可以支持强直性脊柱炎,反应性关节炎或者与HLA-B27相关的一些其他的自身免疫性疾病,如果病人是一位年轻的男性,而且病发于四十岁前,那么这类诊断的正确性就更大了。
如果HLA-B27检查结果是阴性,有助于支持没有上述疾病的诊断,然而这并不意味着就能完全排除上述疾病的可疑诊断,因为在一定的百分比内有的病人可以是HLA-B27阴性,在强直性脊柱炎的病人中,大约有90%的人属于HLA-B27阳性,在幼年型类风湿性关节炎中有80%的病人属于HLA-B27阳性,而在反应性关节的病人中有60%到85%的病人属于HLA-B27阳性。