腰痛是临床各科的常见症状，尿路感染病人也常出现腰痛，肾脏包膜、肾盂和输尿管受到刺激和张力增高时均可产生疼痛。根据病因、病位、病变性质和程度的不同，临床上可表现出各种腰痛，如钝胀痛、剧痛、绞痛、酸痛等。尿路感染病人一般以腰酸痛，钝胀痛、剧痛为主，伴有结石时可出现绞痛。急性尿路感染腰痛程度较重，以剧痛、钝痛为主。慢性尿路感染则以腰酸痛常见。
一般情况下下尿路感染不引起腰痛，上尿路感染尤其是有肾积水，尿路结石，肾梗阻时绝大数有腰痛症状。肾脏疾病引起的腰痛有特定的压痛部位，可与其它原因引起的腰痛鉴别：
一，十二肋与脊柱成角处。
二，十二肋与腰肌外缘成角处。
三，肋缘下腹直肌和肋骨连接外侧。
四，上输尿管点，腹直肌外缘平齐处。
五，中输尿管点，两髂前上棘连线与通过耻骨结节所作垂线的相交点，相当于输尿管进入骨盆腔处。
六，下输尿管点，中输尿管点下肋侧，相当于膀胱输尿管处。肾脏疾病所致的腰痛常需与脊柱病变所致的腰痛相鉴别，前者除肾脏病变已波及腰肌外，疼痛与腰部活动无关，也不放射到腿部，后者常因腰部运动或体位运动，而使腰痛加剧，有时还可放射到下肢，呈坐骨神经痛的表现，可做腰椎x线拍片和其他相应的检查以协助诊断。
