一、西医治疗，分为药物治疗、皮质类固醇激素治疗、免疫抑制剂治疗。
药物治疗包括新斯的明、美斯的明等，值得说明的是，此类药物需要长期甚至终身服用，每复发一次都需要加大药量，且仅仅是对症治疗，一旦停药，症状就会复发，而且加重，应防止此类药物对骨头、肾脏、肝脏的损害。
皮质类固醇激素主要适用于单纯眼型重症肌无力，胆碱脂酶抑制剂疗效不佳，而准备进行胸腺摘除的全身型重症肌无力患者，病情恶化又不适于或拒绝做胸腺摘除的重症肌无力患者，但用多大的剂量仍存有争议。
免疫抑制剂一般应用于胆碱酯酶抑制剂和类固醇皮质激素疗效不佳的病人，副作用有恶心、呕吐、厌食、口腔溃疡、脱发、白细胞及血小板减少、出血及肝功能损害等。
二、手术治疗，手术疗法是胸腺或胸腺瘤的切除，此疗法只适用于胸腺增生或者有胸腺瘤的患者，但手术会导致病人的免疫力进一步降低。
三、干细胞的移植，这种疗法运用范围比较狭窄，一般只用于严重的重症肌无力患者，而且费用昂贵，有效率非常低，且治疗效果维持时间比较短，一般能维持几年左右，卫生部已经发文禁止干细胞移植应用于临床。
四、中医治疗重症肌无力，辩证治疗是中医的一大特色，根据中医理论，本病主要是与脾肾肝关系密切，先天不足，后天失养，均可发此病，一般来说，越早治疗效果越好。
