正常的肠道菌群对入侵的致病微生物具有拮抗作用,新生儿生后尚未建立正常的肠道菌群,如果改变饮食使肠道内环境变化或滥用广谱抗生素,就可以使肠道正常菌群平衡失调而患肠道感染,同时维生素k合成有赖于肠道正常菌群的参与,所以肠道菌群失调时除了容易患腹泻外,还可以有呕吐物或者大便中带血。
因为母乳中还有大量体液因子包括武铁蛋白,SIgA等,还有就是巨噬细胞和粒细胞、溶菌酶、溶酶体,有很强的抗肠道感染作用,而家畜乳中虽有某些上述成分,在加热过程中被破坏,而且人工喂养的食物和食具易受污染,人工喂养儿肠道感染发生率明显高于母乳喂婴儿。