迁延性和慢性腹泻病因复杂,感染,物质过敏,酶缺乏,免疫缺陷,药物因素和先天性畸形均可以导致此病出现。以急性腹泻未彻底治疗或者治疗不当从而出现迁延不愈最为常见,在人工喂养营养不良婴幼儿患病率高。
它的原因是由于重症营养不良时胃黏膜萎缩,胃液酸度降低,使胃杀菌屏障作用明显减弱,有利于胃液和十二指肠液中的细菌和酵母菌大量繁殖。在营养不良时十二指肠和空肠粘膜变薄,肠绒毛萎缩变性,细胞脱落增加,双糖酶尤其是乳糖酶活性以及刷状缘肽酶活性降低,小肠有效吸收面积减少,引起各种营养物质的消化吸收不良。
重症营养不良时腹泻小肠上端细菌显著增多,十二指肠内厌氧菌和酵母菌过度增殖,由于大量细菌对胆酸的降解作用,使游离胆酸浓度增高损害小肠细胞,同时妨碍脂肪微粒形成。