目前有关此病的病因,至今尚不清楚,可能与多种因素有关,其中包括感染因素和遗传因素,虽然许多关于细菌,病毒,支原体和衣原体感染。
与本病有关的报道,但是目前都不能证实是诱导本病的直接原因,细菌包括,链球菌,志贺菌,空肠弯曲菌,和沙门菌属等,病毒包括细小病毒b19,风疹和b病毒。
遗传学方面,目前许多资料证实,幼年特发性关节炎具有遗传学背景,研究最多的是人类白细胞抗原,也就是HLA,具有HLA,DR4,DR8和DR5为点,这些是幼年特发性关节炎的,易发病人群,其它发病有关的,HLA为点,是DR6和A2等。