羊水中混有胎粪是诊断胎粪吸入综合征的先决条件,胎儿在宫内或者是分娩过程中出现缺氧,使肠蠕动增加和肛门括约肌松弛而排出胎粪。同时缺氧使胎儿出现喘息样呼吸,将混有胎粪的羊水吸入气管和肺内,生后初期的呼吸更进一步加重胎粪的阻塞作用。
其次是化学性的反应多发生在生后24~48小时,胎粪刺激局部支气管和肺泡上皮引起化学性的炎症,导致弥漫和通气功能障碍,从而加重低氧血症和高碳酸血症。严重的胎粪吸入综合征可以继发肺动脉高压,肺动脉高压是由严重的缺氧和混合性的酸中毒导致血管痉挛或者肺血管肌层的增生,使肺血管阻力的增加。