在抗生素应用之前感染性心内膜炎常常是致命的,尽管现在诊断技术,外科技术及支持性护理的水平极大提高,尽管患者已及时得到适当的抗生素治疗,仍有大量的感染性心内膜炎患者死于毒力很强的微生物,然而大多数患者幸存下来。
内酰胺类药物,例如青霉素和氨基糖苷类联合治疗的方法被证明在治疗链球菌心内膜炎十分有效。对于一部分葡萄球菌心内膜炎的患者较为有效。氨基糖苷类联合应用青霉素或头孢曲松持续给药两周,对治疗草绿色链球菌心内膜炎高度有效。对于金黄色葡萄球菌引起的右侧房室的感染性心内膜炎,新青霉素三和氨基糖苷类联合应用两周已被证明有效。