慢性肝炎的治疗包括多个方面，保肝抗纤维化，抗病毒去除病因，预防肝癌等，其中针对不同的病因，并去除病因是慢性肝炎中治疗最重要的原则。
第一、保肝治疗，药物种类比较多，包括甘草酸类制剂，激素类制剂，五味子类制剂，适用于所有慢性肝炎的病人。
第二、抗纤维化治疗，多为中成药的口服制剂。
第三、注射干扰素抗病毒治疗，包括普通干扰素和聚乙二醇化干扰素，适合于慢性乙肝以及慢性丙肝的患者，疗程至少一年，干扰素联合利巴韦林是慢性丙肝的治疗标准方案之一。
第四、口服核苷类似物抗病毒治疗，这类药物只适用于乙型肝炎，包括慢性乙型肝炎和乙肝肝硬化，药物有拉米夫定，阿德福韦酯，替比夫定和恩替卡韦，国际上还有第五种药即替诺福韦。
第五、免疫抑制剂，自身免疫性肝炎，在保肝药物难以控制，且肝功能反复时，那么需要用糖皮质激素或者是联合使用另一种免疫抑制剂硫唑嘌呤类，可促进病情的恢复。
第六、预防肿瘤的发生，慢性肝炎病史发生肝癌的几率增加，因此可以补充微量元素硒，有助于增强机体抗癌能力，另外注射胸腺肽提高免疫功能，也有利于增强预防肿瘤的能力。
第七、去除病因，停止服用损伤肝脏的药物，对酒精性肝病以及药物性肝炎的患者至关重要，对于其他原因导致的慢性肝炎也有重要意义。
