疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的,以急性发热和咽峡部疱疹溃疡为特征的急性传染性咽峡炎,接口和呼吸道为主要传播途径,手足口病是由肠道病毒引起的传染病,所以疱疹性咽峡炎和手足口病都是由于病毒感染引起的疾病,但是疱疹性咽峡炎只是上呼吸道的感染。
而手足口病是全身性的传染病,两者的发病部位不同。疱疹性咽峡炎皮疹主要是局限在咽下部和上额,手足口病除了口腔里面的皮疹,还会出现手心、脚心等其他部位,需要家长注意仔细的观察。但是,都是由于病毒感染所导致的,治疗原则基本差不多。虽然疱疹性咽峡炎和手足口病有很大的区别,而且两种症状严重程度也不是特别相同,但是都是需要采取应用抗病毒的药物进行治疗。