治疗牙周炎的时间主要分为以下四个阶段：
一：牙周基础治疗，要消除各种可能的致病因素，消除和控制牙周组织的炎症包括传授和指导教患者进行自我菌斑控制，规劝患者戒烟、戒酒。常规的影响牙质龈下刮治、根面平整，必要的牙体、牙髓的治疗。必要的咬合、咬整，必要的保值有价值的患牙，必要的药物治疗通常需要一两个月才能完成。
二：牙周手术治疗，是牙周治疗的第二个阶段一般在基础治疗后一到三个月时对于牙周状况进行再次的全面评估包括牙菌病控制、牙周袋深度探测出血情况、牙槽骨形态等，切记没有经过牙周基础治疗，没有很好的控制炎症就进行牙周手术。
三：治疗牙周修复，治疗阶段是牙周治疗的第三个阶段，通常在牙周手术后两到三个月时进行，因此时牙周组织的形态和位置已基本稳定，可以进行永久性的修复治疗和松动牙的固定。需要进行正畸治疗的患者，也可以在这个时期进行。
四：牙周支持治疗，是牙周治疗的第四个阶段，以往称为恢复期，同样是很重要阶段，在此需要定期复查检查患者菌斑控制情况，牙龈炎症情况牙周袋深度、牙槽骨的变化以及危险因素的控制情况，发现问题进行必要的再次治疗。
复查的间隔时间通常需要三到六个月复查一次，一年左右拍一次x线片。
