目前为止，还没有明确的证据显示，药物对厌食症患者的体重增长或者是核心症状有显著改善作用，不建议作为治疗神经性厌食的单独或者是主要方法。
神经性厌食的精神药物治疗，主要是用于减轻患者的焦虑或者是激惹、敌对等情绪症状。协助饮食恢复或者是心理治疗或缓解相关的控欲问题。应该谨慎使用药物治疗，厌食症患者的焦虑、抑郁或强迫症状，因为这些可能单靠体重增加就能缓解。如果说厌食症患者在体重恢复正常以后，仍有贪食、易于焦虑或强迫症状，就可以选择应用选择性五羟色胺再摄取抑制剂类药物。
当使用药物治疗神经性厌食患者的时候，应该认真的考虑药物治疗的不良反应，特别是心脏方面的不良反应。对心脏并发症风险的神经性厌食症患者，应该避免使用可能损害心脏功能的药物，如果必须使用，应该进行心电监护。
另外，安非他酮在神经性贪食患者当中，可能会引发癫痫发作，增加癫痫的可能性，尤其是伴有贪食症状的神经性厌食症的患者。虽然，没有药物试验对选择性五羟色胺再摄取抑制剂以外的其他抗抑郁药，在这个神经性厌食患者当中的一个疗效对比观察。但是，因为抗抑郁药更容易在营养不良的患者当中，引起不良反应，所以说应该尽量的避免。抗精神病药物，尤其是奥氮平、利培酮、阿立哌唑已经被用于少数的患者，仍然需要从小剂量开始，注意观察它的不良反应。
