情感障碍有关的睡眠症按照发病机制,目前来说还不是非常的明确。但是,睡眠和觉醒的神经生化调节和情感障碍的发病机制有很多的讲述之间是相互联系的,降低了脑内去钾肾上腺素为出现快速眼动相睡眠的增加,提高脑内去钾肾上腺素,会使出现快速眼动像睡眠减少;五羟色胺与睡眠的关系也是非常密切的,五羟色胺作为产生睡眠的重要递质,并且和快速眼动像睡眠发生关系密切。
γ氨基丁酸和睡眠关系,强光会引起睡眠当中脑细胞的γ氨基丁酸的水平增加,去甲肾上腺素和五羟色胺、γ氨基丁酸,在情感性障碍,特别是抑郁症发病中的重要作用,就推测这些神经递质的异常和情感障碍和相关的睡眠障碍的发病机制有关系。