睡眠相关性头痛的鉴别诊断,必须包括焦虑,紧张,抑郁相关的新型头痛,尤其是与紧张性头痛相鉴别,紧张性头痛,临床十分常见,常常呈现一个双侧分布或者是中线分布,表现为一个紧压样的头痛,几乎是一个持续性的,往往还会伴有焦虑和抑郁。
因为颅内压升高,比方动静脉畸形,肿瘤,血肿等所导致的头痛,心血管疾病所导致的头痛,骨骼神经患脑膜炎所导致的头痛,外伤所致的头痛症,这些疾病都有它各自的临床特点,它与睡眠相关性头痛进行鉴别并不是很困难。
还有除外一些阻塞性睡眠呼吸暂停综合征,常常表现为晨间头痛,通过睡眠,呼吸,监测很容易将两者之间进行鉴别开来。