对于鼻窦炎引起的各种症状，药物治疗不见好转时就应该考虑采用手术治疗。手术治疗有很多种，具体做何种手术需要医生看病人的具体情况，对鼻腔鼻窦进行详细的检查才能决定。鼻窦炎的手术效果比较肯定，病人应该对鼻窦炎手术治疗有明确的信心。
传统的鼻窦炎手术包括上颌窦根治术，也就是将通过打开上颌窦前壁，清除上颌窦内的炎症，并将其内壁与鼻腔相通。但近年来由于鼻内窥镜技术的发展，手术适应范围已经大大减少，主要用于牙源性上颌窦炎及霉菌性上颌窦炎或者有鼻窦肿瘤者。
鼻窦炎手术治疗最主要功能性鼻内窥镜手术，鼻窦内窥镜治疗鼻窦炎的原理也就是通过鼻窦内窥镜直接开放鼻窦的开口，从而使鼻窦与外界相通，从而达到根治鼻窦炎的目的。采用此种手术治疗后，鼻窦炎一般都可以得到很好的治疗。
鼻窦炎的手术治疗还需要根据鼻窦炎的最根本原因来进行治疗，如鼻中隔偏曲时可以阻塞鼻窦的开口，医生可能会建议进行鼻中隔偏曲矫正术。
如果是鼻息肉伴有鼻窦炎，则同时需要将鼻息肉彻底的摘除，尤其是鼻息肉病，往往同时伴有鼻窦炎，已经被做为疾病的分类，被称为慢性鼻窦炎鼻息肉。
鼻窦炎的手术治疗一般比较安全，效果也很可靠的，常见的鼻窦炎手术术后1周左右基本可以恢复正常。
