肺炎支原体所致的感染很多是无症状的,如果有症状常常症状明显,但体格检查却轻微异常。常见的症状包括咳嗽,发热,头痛,咽喉疼痛的,其中超过75%的患者会有顽固性干咳,只有3%到10%的患者发展为肺炎,大多数肺炎支原体引起的肺炎是轻度,自限性的,但也有爆发臂力。
除此之外、肺炎支原体感染,还可能引起呼吸道之外的异常,包括溶血,皮肤斑丘疹或水泡疹,中枢神经系统受累时可能出现脑炎,心脏受累时可能出现心律失常或充血性心率衰竭,多关节疼痛和肌肉,肾小球肾炎等消化系统症状时,可能会出现肝炎或胰腺炎等。但呼吸系统之外受累的发生概率不超过5%到10%,神经系统受累不超过0.1%的。