不同物质和诱物导致神经认知障碍的机制也是不相同的:
一、酒精或吸入性溶剂具有直接的神经毒性,造成永久的脑损害,从而导致持久性的神经认知障碍,通过实践发现患者往往具有白质的体积减少以及神经元的丧失,尤其是集中在上部额叶皮质,不同部位受损可能会引起不同类型的记忆障碍,如颞叶、海马区受损主要是引起空间记忆障碍,杏仁核区受损主要引起情感记忆障碍等等。
二、其他的物质,如可卡因、阿片类的也可以造成间接的脑损害,比方说苯丙胺类药物以及可卡因滥用可以造成脑的微小血管炎,继而出现神经认知障碍。
三、苯丙胺类兴奋剂等毒品具有明显的神经毒性,对于五羟色胺或多巴胺神经元,都有一些明显的损害,而且能累及边缘系统,皮质、海马和杏仁核的多个区域,这些区域又和个体的认知功能密切相关,短期使用苯二氮卓类药物可以导致遗忘效应,这和药物的镇静功能密切相关。