有一些情况的女性是不适合使用联合激素避孕方法的,比如现在或者原来有过静脉血栓的栓塞、还有就是遗传性的易栓症、另外就是冠状动脉疾病、合并有比较严重的脑血管疾病、没有控制的高血压、严重的肝功能的异常、乳腺和生殖系统的恶性肿瘤或者是偏头痛的征兆,比如传统的偏头痛伴随局部的神经症状,这样它会有脑卒中风险的增加。
如果存在口服避孕药的禁忌症,可以调整避孕方法,使用仅含孕激素的方法或者非激素的方法。强烈建议吸烟的患者戒烟,特别是35岁以上的,使用联合激素避孕方法的女性当中吸烟者的血栓栓塞和心血管事件风险比不吸烟的要高的多。口服的联合避孕药可以用于hiv感染阳性的女性,但是抗反转录病毒药物可能会降低或增加激素避孕药中类固醇的生物利用度。