这个疾病主要的并发症是感染性的心内膜炎,与疾病的致残率和死亡率有关,所以一定要注意用抗生素,积极预防,控制感染性心内膜炎的发生,而且要注意猝死的预防,胺碘酮对防治肥厚型梗阻性心肌病合并的心律失常有效果,而且减轻症状可以改善运动耐量。
这个疾病的患者容易发生快速型的室性心律失常和猝死,这可能和心肌细胞排列异常,心肌纤维化导致心电生理异常有关系,猝死可发生于无症状或症状轻的患者或左心室肥厚程度并且不十分严重的患者,所以在临床上凡是有家族病史,有不可解释的反复晕厥史,反复发作的非持续性室速或者持续性的室速者,以及运动后血压突然异常反应,均认为是猝死的高危患者,对这些患者主张都应用胺碘酮或者安置ICD作为一级预防的。