川崎病的病因目前尚不明确,临床表现有发热、皮疹等感染证据,推测与感染有关,一般认为可能是与多种病原体,包括Eb病毒,逆转录病毒或者是链球菌感染有关。
1986年曾报道患者外周血淋巴细胞培养上清液中逆转录酶活性增高,提示该病可能为逆转录病毒引起,但是多数研究并没有获得一致性的结果。所以认为病原体有呼吸道和消化道进入体内,并引发了免疫反应,可能与本病发病有关。
日本人及日裔、美国人川崎病的发病率较高,这提示遗传因素可能起到一定的作用,也有人考虑环境污染或者是化学物品,过敏及螨虫等,也可能与本病有关。总之,至今尚不能明确,何种感染因子以何种传播途径引起川崎病。