首先，脱水和电解质紊乱腹泻时，机体不仅不能有效的从食物中吸收水分和电解质，而且还会以肠液的形式进一步丢失。所以腹泻时如果不能及时有效的补充水分和电解质就会出现不同程度的脱水和电解质紊乱。其中电解质紊乱包括低钠、低钾、低钙和低镁，不仅不利于疾病的恢复，而且还会给孩子带来不必要的痛苦，例如低钾可以引起腹胀，低钙可以引起手足抽搐。
二、病毒性心肌炎，发生在肠道病毒感染所致的腹泻之后，使患儿的抵抗力进一步下降，就可以侵犯心脏引起病毒性心肌炎。并发此病的患儿会有胸闷、胸痛、心悸、头晕、乏力等症状，这种患儿会因为严重的心律失常导致心力衰竭、心源性休克，甚至危及生命。
三、肠套叠，小儿常见的急腹症之一，多见于四到十个月的婴儿，随着年龄的增长发病率逐渐降低。大多数婴儿肠套叠是原发性的，只有2%到8%的病例为继发性，由于肠蠕动失去正常节律性，肠缓肌发生持续性局部痉挛，肠近端剧烈蠕动，将痉挛的肠段推入远端肠腔内，腹泻和伴随病毒感染是引起肠套叠的主要原因。
四、营养不良，多发生在迁延性腹泻和慢性腹泻之后，营养不良会使患儿的抵抗力进一步下降，继发各种感染，如鹅口疮、支气管肺炎、结核病、中耳炎、尿路感染等，而且腹泻迁延不愈，还会加重营养不良，造成恶性循环。
