急性鼻窦炎多由上呼吸道感染引起,细菌和病毒感染可同时并发,常见的细菌菌群是肺炎链球菌、溶血性链球菌和葡萄球菌等多种化脓性球菌。其次为流感嗜血杆菌和卡他菌属,后者常见于儿童,其它的致病菌还有链球菌类、厌氧菌和金黄色葡萄球菌,有牙病引起者多属于厌氧菌感染,脓液常带恶臭,真菌过敏也可能是致病因素。
慢性鼻窦炎由急性鼻窦炎转变而来,多应对急性鼻窦炎治疗不当,或对其未进行彻底治疗以致反复发作,迁延不愈,使之转化为慢性,此为本病的首要病因。阻塞性鼻炎鼻腔内的阻塞性疾病,如鼻息肉、鼻甲肥大、鼻腔结石等,致病菌毒力强以及牙源性感染、外伤和异物,鼻窦解剖因素不利于通气引流,也为不可忽略的自身因素,还包括全身性因素,各种慢性疾病、营养不良、疲劳过度等。