根据发病时间的不同,食管气管瘘可分为先天性与获得性,根据发病原因的不同,获得性食管气管瘘又可分为三种类型,良性食管气管瘘、恶性食管气管瘘与创伤性食管气管瘘。
在1960年以前,良性食管气管瘘最常见的病因是肉芽肿性炎症和外伤,后来常见病因为气管内或气管切开后的气管插管套囊过度充气,由于长期机械通气,病人一般都放有胃管气管套囊,将气管膜部的前壁挤压在胃管上,导致该处管壁全层坏死,形成了瘘,恶性食管气管瘘多见于食管癌。创伤性食管气管瘘在颈部常为直接锐器伤,在胸部常为胸廓创击或车祸,位于胸骨和腰椎间的气管和食管受到严重挤压,形成食管气管瘘。