自然流产的处理是根据自然流产不同的类型，来决定的：
第一，先兆流产，先兆流产要给予保胎治疗，适当的休息，禁止性生活，黄体功能不全的给予黄体酮，保胎治疗，甲胎性功能减退的，给予小剂量的甲胎性素保胎治疗，并动态观察血HCG数值的变化，彩超，就是提示宫内存活的情况下，可以继续妊娠。
第二点，难娩流产，一旦确诊，应该尽早地使胚胎或者是胎盘组织完整的排出，并给予抗生素预防感染。
不全流产，已经确诊应尽快行刮宫术或者是减压术清除宫腔内的残留的组织，阴道大流血，伴有休克的时候可以同时给予输血，输液治疗，并给予抗生素预防感染。
完全流产，如果流产的症状消失，超声检查证实宫腔内没有残留的妊娠物，如果没有感染的征象，不需要特殊处理，意思是稽留流产，处理比较困难，胎盘的组织激化与子宫壁紧密粘连，致使刮宫困难，晚期流产滞留的时间长，可以发生凝血功能障碍，造成严重的贫血，处理前应检查血常规血、血小板以及凝血功能，并做好输血的准备。如果凝血功能正常，可以先口服三到五天的雌激素类的药物，提高子宫肌对缩宫素的敏感性。
如果子宫小于十二周，可行刮宫术，术中尽力注射缩宫素，刮宫时，特别小心，避免子宫穿孔，一次刮不干净，可以带五到七日以后，再次刮宫，子宫大于十二孕周者，可以使用米非司酮加米索前列醇或者是静脉滴注缩宫素促使胎儿、胎盘娩出，若出现凝血功能障碍，应尽早输入新鲜的血、血浆纤维蛋白原等，带凝血功能好转以后，再行刮宫。
