肠阿米巴病好发部位依次为盲肠、直肠和乙状结肠。对于阿米巴病,有的时候也会蔓延到肛周皮肤,泌尿生殖等器官。爆发型肠阿米巴病疾病集聚,全身营养状况差,中毒症状显著,可伴有高热、寒战、谵妄、腹痛、里急后重,大便为脓血便,有恶臭,也可呈水样或胶水样大便,伴呕吐虚脱,有不同程度的脱水和电解质紊乱。
血液检查中中性粒细胞细胞增多,易并发肠出血或肠穿孔,可变为慢性的阿米巴肠病,常为急性感染的延续,腹泻与便秘交替出现,病程持续数月甚至数年。复发常由于饮食不当,暴饮暴食,饮酒,受寒,疲劳等,大便呈糊状,可查到滋养体和包囊,有患者有不同程度的贫血,消瘦以及消化不良。