与放疗相比,同期放、化疗有着较高的毒性反应,在放疗后其常导致放置肾炎内明显的局部黏膜炎、皮肤反应以及营养问题,这使得任何计划好的辅助化疗均需延期进行,辅助化疗的毒性大滴虫性很差,而这也是许多临床研究在治疗局部晚期鼻咽癌中面临的情况,如意大利和ECOG的在临床研究比较,同期放化疗后辅助化疗与单纯放疗的三期临床研究中,联合治疗组相当一部分患者无法接受辅助化疗;
此外在鼻咽癌局部复发时,行鼻咽病灶切手术或者是根治性的清剿术后辅助化疗可能有一定的价值,这种情况在同其放化疗时代相对少见,但在再次放疗毒性风险高的情况下值得考虑。