肠旋转不良的总体预后良好,手术相关死亡率在3%到9%,在中肠扭转,小肠坏死,早产儿和合并其他畸形的患儿中死亡率增加,改善预后的关键因素包括,将患儿置于重症监护室治疗,进行周围和中心静脉营养支持。
早期诊断,对肠扭转的高度警惕,紧急处理技术的提高,均明显改善,肠旋转不良的预后。
长期预后的随访对于切除坏死肠管后营养吸收障碍,以残存肠管的长度和功能而定,有时遗留间歇性腹痛顽固的消化吸收障碍贫血,血浆蛋白质偏低,术后胃肠道功能紊乱是常见现象,
第二是再次扭转发生率低,肠扭转复发,在开放性手术小于0.5%,但在腹腔镜手术中可高达19%,肠系膜根部分离不够,系膜展平后宽度不够,术后肠管间黏连少是增加肠扭转复发率的高危因素,黏连性肠梗阻在开放性手术多间见,50%的黏连性肠梗阻需要再住院,25%需要再手术。理论上黏连性肠梗阻的发生率在腹腔镜手术中较低,新生儿腹腔容量少,腹腔镜手术具有一定困难,评估腹腔镜治疗肠旋转不良的合理性与效果还需长期研究。