滴虫性阴道炎的治疗主要包括以下几个方面：
（1）全身用药，初次治疗可以选择甲硝唑，两克单次口服或者是替硝唑两克单次口服，或者是甲硝唑四百毫克每日两次，连服七天，甲硝唑在用药期间及停药2小时之内，七小时用药期间或者是停药72小时之内要禁止饮酒，哺乳期用药不能再继续哺乳。
（2）性伴侣的治疗，滴虫性阴道炎主要由性行为传播，性伴侣应同时进行治疗。
(3)随访以及治疗失败的处理，由于滴虫性阴道炎的患者在感染率很高，可考虑对患有滴虫阴道炎的性活跃的妇女，在最初感染三个月以后要重新进行筛查，对于甲硝唑两克，单次口服治疗失败，而且要排除再次感染者，可以增加甲硝唑的疗程和剂量，仍然有效。
（4）妊娠合并滴虫性阴道炎的治疗，可以导致胎膜早破，早产以及低出生体重儿，治疗妊娠期的滴虫性阴道炎，可以减轻明显的症状，减少传播，防止心衰，呼吸道和生殖道的感染。
使用甲硝唑时，最好要取得患者或者其家属的同意。
（5）治疗症的注意事项，有复发症状的病例，大多数重复感染，为避免重复感染，内裤或者是洗过用过的毛巾，应该煮浮五到十分钟，消除病原体，并应该对其性伴侣进行治疗，因为滴虫性阴道炎可合并其他性传播疾病，应注意有无其他性传播疾病。
