在食道闭锁的患儿长期并发症中,食管的功能障碍占有很重要的地位,食管功能障碍和食管内在神经分布异常有关,也可导致反复隐匿性吸入事件发生,引起呼吸系统并发症。
长期的随访发现,青少年中,轻中度吞咽困难,约占20%,成人中增加至48%,食道闭锁、胃食管反流可以持续至成年,新生儿期接受吻合手术治疗的成人往往享受较好的生活质量,生活质量测试显示,相比结肠替代治疗,原位的食管修补的患者享有更好的生活。
心理评估测试显示,相比正常人群食道闭锁的患者在成年以后在学习、情感、交流行为上存有一定困难,尤其在高危险人群中,如果合并了其他重要先天畸形或者新生儿期需要长时间机械通气者,其认知性能明显受损。