肾和输尿管结石又称上尿路结石，主要症状是疼痛和血尿，其程度与结石的部位、大小、活动与否、以及有无损伤、感染等有关。
疼痛，肾结石可引起肾区疼痛，伴叩击痛。肾盂内大结石、肾胆结石可无明显临床症状，活动后出现上腹和腰部钝痛。输尿管结石可引起肾绞痛，表现为疼痛剧烈难忍，阵发性发作位于腰部或上腹部，并延输尿管行径放射至同侧腹股沟，还可累及同侧睾丸或阴唇。结石在中段输尿管疼痛放射至中下腹部，结石出于输尿管、膀胱壁段或输尿管口，可伴有膀胱刺激症、及尿道和阴茎头部放射痛。肾绞痛常见于结石活动，并引起输尿管梗阻的情况。
血尿，通常病人都有肉眼血尿和镜下血尿。镜下血尿更为常见，有时活动后镜下血尿是上尿路结石的唯一临床表现。
恶心，呕吐，输尿管结石引起尿路完全性梗阻时，使输尿管管腔内压力升高，使管壁局部扩张痉挛和缺血，由于输尿管与肠有共同的神经支配而导致恶心呕吐。
膀胱刺激征，结石伴感染或输尿管膀胱壁段结石时，可有尿频、尿急、尿痛。
并发症的表现，结石激发急性肾盂肾炎或肾积脓时，可有胃寒、发热、寒颤等全身症状。结石所致肾积水，可在上腹部触及增大的肾，双侧上尿路结石引起双侧尿路完全性梗阻，或孤立肾上尿路完全梗阻时可导致无尿，出现尿毒症。
