肾结核主要是由于血行播散到肾脏引起,还有一种情况是可以由生殖系统的结核经过淋巴系统逆行传播到肾脏,肾结核菌达到肾皮质后在肾小球毛细血管丛,在肾皮质内形成多发细小的病灶,这种病灶有两种转归,第一种是自然愈合不引起任何的症状,这种类型称之为临床型结核、非临床型结核或病理性结核。
第二种情况是发生抵抗力比较差,对结核免疫力比较低,它可以逐渐发展为慢性进行性结核性病变,表现为临床型肾结核,结核菌通过血行播散停留肾小球周围毛细血管随后形成了皮质的肉芽肿,再进一步发展为肾髓质结核、肾乳头、肾小盏破坏形成空洞,冷脓肿进而侵犯到肾盂、全肾并向下尿路蔓延,肾结核在破坏的同时也发生纤维增生瘢痕化以及钙化,沉浊最终才导致肾萎缩产生自截肾。