尿频、尿急、腰痛的病因很多,主要是膀胱和尿道疾病,包括感染性疾病,如普通细菌,结核杆菌,真菌,寄生虫等引起的膀胱炎,尿道炎,前列腺炎,尿道旁腺炎,龟头炎,阴道炎,尖锐湿疣等等。
非感染性炎症如间质性膀胱炎,放射性膀胱炎,化学性膀胱炎,结石,如膀胱结石,尿道结石,输尿管下段结石,膀胱尿道前列腺肿瘤,膀胱和尿道内异物等等。尿道狭窄尿道口过小,处女膜伞异常,包茎等等也可以引起尿频、尿急、尿痛。
除膀胱和尿道疾病外,肾盂肾炎,肾积脓,肾结核等肾脏疾病。膀胱尿道邻近器官子宫,卵巢,结肠等疾病,神经性膀胱等精神神经系统疾病和白塞病等全身性疾病都可以引起尿频、尿急、尿痛。