抗菌药物主要用于细菌,真菌,结核分枝杆菌,非结核分枝杆菌,支原体,衣原体感染以及螺旋体,立克次体及部分原虫等病原微生物所致的感染,如缺乏细菌及上述病原微生物感染的证据,及病毒性感染者均无应用抗菌药物的指征。
抗菌药物联合应用拥有明确指征,单一药物可有效治疗的感染,不许联合用药。在下列情况时联合用药,病原菌尚未查明的严重感染,包括免疫缺陷者的严重感染,单一抗菌药物不能控制的需氧菌及厌氧菌混合感染,两种或两种以上病原菌感染,单一抗菌药物不能有效控制的感染性心内膜炎或败血症等重症感染,需长程治疗。但病原菌易对某些抗菌药物产生耐药性的感染,如结核病,深部真菌等。