由于绝大多数的溶血性尿毒症综合征病人是由于感染所继发,因而理论上抗生素可能对治疗有帮助,但由于抗生素破坏细菌后,引起大量毒素释放和杀灭肠道内正常菌群,而使菌群失调。
另外、一些抗生素,如甲氧苄啶和呋喃唑酮等药物,可以使细菌表达志贺菌毒素2增加,实际上抗生素的使用使志贺菌毒素相关的溶血性尿毒症综合征病人出血性腹泻的风险大大增加,因此志贺菌毒素相关的溶血性尿毒症综合征病人不宜使用抗生素。
但对于其他一些感染后溶血性尿毒症综合征病人,如志贺痢疾杆菌1型和肺炎球菌引起的早期经验性给予抗生素,可能是有益。