患者可发生听力减退、耳鸣或耳部饱满感。少数患者亦可发生眩晕、步履不稳等症状，听力减退一般于停药后症状不再加重。但个别在停药后可能继续发展至耳聋。阿米卡星有一定肾毒性患者可出现血尿、排尿次数减少或尿量减少，血尿素氮、血肌酐值增高等，大多系可逆性。停药后即见减轻，但亦有个别报道出现肾功能衰竭，在用药过程中应注意尿常规和肾功能测定，以防止出现严重肾毒性反应。注意听力检查或听电图检查，尤其注意高频听力损害，这对老年患者尤为重要。疗程中有条件时应监测血药浓度尤其新生儿、老年和肾功能减退患者。
下列情况应慎用阿米卡星。一、失水。可使血药浓度增高易产生毒性反应。二、第8对脑神经损害，因阿米卡星可导致前庭神经和听神经损害。三、重症肌无力或帕金森病。因本病可引起神经肌肉阻滞作用导致骨骼肌软弱。四、肾功能损害者。因阿米卡星具有肾毒性阿米卡星可使丙氨酸氨基转移酶、门冬氨酸氨基转移酶、血清胆红素浓度及乳酸脱氢酶浓度的测定值增高。血钙、镁、钾、钠浓度的测定值可能降低。氨基糖苷类与β内酰胺类混合时可导致相互失活，阿米卡星与上述抗生素联合应用时必须分瓶滴注。阿米卡星亦不宜与其他药物同瓶滴注应给予患者足够的水分，以减少肾小管损害。阿米卡星与其他氨基糖苷类合用或先后连续局部或全身应用可增加耳毒性、肾毒性及神经肌肉阻滞作用，与神经肌肉阻断药合用。可加重神经肌肉阻滞作用导致肌肉软弱、呼吸抑制等症状与卷曲霉素、顺铂、依他尼酸、呋塞米或万古霉素等合用，或先后连续局部或全身应用。可能增加耳毒性与肾毒性与头孢噻吩或头孢唑林局部，或全身合用可能增加肾毒性。不宜与两性霉素B头孢噻吩磺胺嘧啶和四环素等注射剂配伍，不在同一瓶中滴注与多粘菌素类注射剂合用或先后连续局部或全身应用，可增加肾毒性和神经肌肉阻滞作用。其他肾毒性药物及耳毒性药物均不宜与阿米卡星合用或先后应用以免加重肾毒性或耳毒性。
