需要注意的情况：第一，用药前怀疑有胃溃疡或已患有胃溃疡时，要先排除胃恶性肿瘤。第二、长期进行艾司奥美拉唑治疗时，要注意萎缩性胃炎的发生。第三、艰难梭杆菌相关性腹泻。第四、避免和氯吡格雷、奈非那韦、贯叶连翘、利福平来合用。第五、长期或者高剂量服用此药的要注意髋关节、腕关节或脊髓等这些部位骨折的风险。第六、服药3个月或更长时间者，合用地高辛或者能导致低镁血症的药物，比如利尿剂，这些情况要定期监测血镁浓度。第七、高剂量甲氨喋呤治疗时，可以考虑暂停使用艾司奥美拉唑。第八、乳糖耐受不好，葡萄糖-半乳糖吸收障碍的，蔗糖酶-异麦芽糖酶不足的患者，不可以服用本品。
第九、注意消化道的感染。第十、不建议与阿扎那韦来合用。十一、长期使用该药，尤其是使用1年以上的患者，应定期进行监测。十二、要注意维生素B12，吸收减少或者缺乏。十三、艾司奥美拉唑可能影响酮康唑、伊曲康唑、阿扎那韦、铁盐和地高辛这些药物的吸收。十四、与华法林合用，需要对凝血酶国际标准化比值和凝血酶原时间增加的情况进行监测。十五、本品与地西泮、西酞普兰、丙咪嗪、氯米帕明、苯妥英合用时，可能需要降低这些药的剂量。苯妥英治疗期间，合用或停用本品时建议监测苯妥英的血药浓度。十六、与他克莫司合用，可导致他克莫司血药浓度增加。十七、与克拉霉素联用时，禁止与西沙必利、匹莫齐特、阿司咪唑，特非那定、麦角胺或二氢麦角胺等药物进行治疗。十八、对过量中毒的治疗，应采用对症处理或全身支持疗法。
特殊人群的用药：第一、老年人以及肾功能损害的患者，不需要调整剂量。第二、轻度和中度的肝功能损害者，不需要调整剂量。严重肝功能损害者，剂量不应该超过20毫克。第三、妊娠期应慎用，儿童和哺乳期不应使用本品。
