目前为止全世界对于先天性心脏病，它的具体机制，还没有一个确切的，公认的答案，但是可以有一些高危的因素。先心病分两大类，一种叫综合征先心病，一种叫非综合征先心病。综合征先心病是占比较少数的，非综合征先心病，顾名思义就是我们绝大多数，临床能见到的这些先心病人。它的主要的高危因素，是在孕期前三个月，心脏胚胎发育形成心脏的这个阶段，受到外来因素干扰，造成了心脏大血管，不能够正常的发育，所以形成了各种各样的先心病。
这些高危因素包括：
第一，是孕早期的感染。比如病毒的感染，巨细胞病毒、风疹病毒等等；
第二，是孕妇不小心服药了，很多药物是会干扰孩子的心脏发育的。
第三，就是在孕早期，接触有毒有害的环境物质。比如接触一些化工产品、辐射等等。
第四，孕妇有严重的不良嗜好，比如酗酒，吸烟。
第五，高龄的孕妇，她的患有先心病的患儿，可能发病率更高一些。
第六，在高原上，一些缺氧环境，先心病的发病率也会增高。
有些家长总是在疑惑，先心病是不是有遗传，我们说遗传因素，占总体先心病病人的大概不足8%，也就是说90%以上先心病人，都跟遗传是没有关系的。先心病的遗传主要表现家族式，比如妈妈有先心病，孩子有先心病，或者说上一代有先心病，到父母这一代有先心病，孩子有一定的先心病几率。或者说是妈妈，第一胎生下的孩子有先心病，那么第二胎生育的孩子，先心病有一定几率的增加，这个方面跟遗传是有关系。
还有一大类跟遗传有关系的，就是这种综合征先心病，本身它就是染色体的异常，或基因的突变造成的，它可能有家族的因素等，也可能是受外界干扰，偶发的这种基因突变，或者染色体的变异。
