第一是阴茎黑色素沉着症，在临床上比较少见。长期有龟头和阴茎体部，表现为色素沉着的斑疹，边界不清楚，那么这是良性病变。但要通过组织病理学，要与恶性做鉴别。
第二是阴茎海绵状血管瘤，就是龟头上有大小不等的青紫色或紫蓝色的结节状团块，特点是压着褪色，一松手迅速复原。还有鲍恩样丘疹病，这是个皮肤病。就是阴茎皮肤多发性的扁平的丘疹，病灶是有两三个毫米，大的可以到两三个厘米，大小不等，那么可以伴有色素沉着，呈淡褐色或深褐色。那么小的病灶可以融合成大的病灶，那么这个诊断也需要活检来证实。这个病组织学上像是原位癌，但实际上它始终都是一个良性的进展过程。
第三是鲍温病，就是阴茎体上，单个的暗红色的斑块，部分区域可以有渗出、结痂，可以表现为油状、结节状，那么它可以伴有色素沉着。那么这个实际上就是就是阴茎癌的一个临床表现一类，临床表现就是阴茎癌的原位癌。
第四是药物性的包皮龟头炎，开始是红色的斑片，然后变成紫斑，然后就是变成了紫黑色的色素沉着。
第五是坏疽性龟头炎，那么这个就是临床比较少见。先是有局部的血液循环障碍，继发感染，那么这样就出现局部皮肤的坏死，而变黑。常常见于一些糖尿病、免疫缺陷病、年老体弱的一些患者。表现为一个就是疼痛性溃疡，质地比较硬，那么机体组织是肉芽组织，一碰就容易出血，表面层坏死组织发黑，甚至皮肤周围也是呈暗黑色的一些表现。
第六是阴茎癌，阴茎癌持续生长以后，它可以阻止血液的回流，还有阻止血液的供应，造成局部的血液供应障碍，造成局部的坏死和溃疡，也表现为一个龟头发黑。
第七是物理的照射，那么常常会伴有色素沉着，也会表现为龟头发黑。
