一般认为,儿童精神分裂症的预后是不良的。五年随访显示80%到90%有两次或两次以上的发作,仅手术完全缓解。如果疾病发作超过一次以上,约80%缓解不完全。
近期预后与精神症状,患者对治疗药物的有效性,治疗资源的利用情况等有关系。远期预后的研究结果是,随访了平均发病年龄十四岁患者,十五年四十例的患者当中仅有两例完全缓解,74%显示是中度和重度的一个功能缺陷。随访发病年龄七到十三岁的患者十六年,五十七例50%明显衰退,30%社会的适应能力良好。20%完全缓解,其中十一例十岁前发病的预后均差。
这些患者四十二年后再做了一次随访,结局几乎是相同的。预后不良的因素有一些因素,像十四岁以下出现症状的,并且人格不健全或者是社会功能差的,慢性疾病的青春型。如果发病年龄比较晚,并且的社会功能良好,智商高于平均水平,急性起病,症状明确,有情感性症状以及偏执型,预后还是比较好的。