肛瘘患者进行灌肠主要是为了清洁肠道，为检查或手术做准备。
灌肠前，医护人员会先让患者排空膀胱，然后采取左侧卧位，双腿屈膝，将臀部尽量靠近床边，这样的姿势有利于灌肠液在肠道内的停留和流动。接着，医护人员会准备好灌肠器具，包括灌肠筒、肛管和润滑剂。一般会使用温生理盐水作为灌肠液，温度通常在39-41摄氏度，这个温度接近人体体温，能减少对肠道的刺激。
灌肠时，医护人员会先将肛管的前端涂抹上润滑剂，比如凡士林，以减轻肛管插入时对肛门和直肠的摩擦。然后，轻轻将肛管插入肛门，插入深度一般在7-10厘米。缓慢地打开灌肠筒的开关，让灌肠液缓缓流入肠道，速度不能太快，通常控制在每分钟100-150毫升，这样可以防止患者产生强烈的便意和不适感。灌肠液的量根据患者的具体情况而定，一般在500-1000毫升。
当灌肠液全部注入后，医护人员会轻轻拔出肛管，然后让患者保持左侧卧位5-10分钟，这样可以让灌肠液在肠道内充分发挥清洁作用。之后，患者会产生便意，此时要尽快去厕所排便，将肠道内的粪便和灌肠液一起排出体外。
在灌肠过程中，患者可能会感到腹部胀满或者轻微的腹痛，这是正常现象。但如果出现剧烈腹痛、心慌、出冷汗等症状，要及时告知医护人员，可能是出现了肠道痉挛或者其他不良反应。
