灌肠的后遗症常见为肠道功能失调、肛门损伤或肛管损伤等。灌肠后会造成肠道内的菌群失调、肠道黏膜损伤从而导致肠道功能失调。灌肠时肛管插入肛门可能会对肛门造成一定的损伤可能导致出血。
灌肠主要是指将肛管插入肛门,加压输入含有泻药或润滑剂的生理盐水或肥皂水,从而起到润滑肠道、刺激肠道的作用,从而促进其排气排便,它主要是针对长期便秘、排便困难和肠梗阻,以促进肠功能的恢复和排气、通便而使用的一种治疗方法。灌肠一般对身体和健康没有明显危害,但灌肠液常用的是甘露醇注射液、硫酸镁溶液或者是肥皂水等,这些药液、化学液体长期使用,可能会对肠粘膜存在一定的刺激,长期灌肠还会引起肠道功能障碍以及肛门黏膜或肛管损伤引起的出血。因此不建议进行高位灌肠和长期灌肠。