疱疹性咽喉炎具有与呼吸道感染相类似的症状，如发热、咽痛、肢体抖动、心率增快等，也可能出现脑炎、无菌性脑膜炎、心肌炎等并发症。在临床上其治疗常以对症治疗及对因治疗为主。
对症治疗方面，存在发热症状，且体温超过38.5℃的患儿，可采用物理降温，如温水擦浴、使用退热贴等，同时也可应用退热药物治疗，如布洛芬、对乙酰氨基酚等；发生高热惊厥时，及时进行止惊治疗，可应用咪达唑仑等药物。在对因治疗方面，虽然尚无特效抗肠道病毒药物，但是早期使用广谱抗病毒药物，如利巴韦林气雾剂、干扰素α等进行治疗，一般会有一定作用。其中利巴韦林气雾剂是一种局部抗病毒药物，相较于口服制剂用药量较小，而且局部药物浓度较高，不良反应相对较低，整体安全性较高。
除用药外，家长要注意尽可能让患儿多喝水，如果咽部疼痛不能喝温开水，可以喝适量的凉开水，饮食宜清淡、柔软，避免吃酸的、烫的食物，还可以适量食用苹果泥或乳制品，发挥补充水分、热量的作用。此外也要注意卫生，用流动水洗手，不用污浊的毛巾擦手，以避免重复感染或交叉感染；家长在接触患儿前后、给患儿更换尿布和处理大便后，都应用肥皂和清水洗手；定期打开门窗，以保持室内空气流通；患儿玩过的玩具、用过的奶具、碗筷或其他衣物等生活用品都应彻底消毒。
如需用药，或者想要了解更多的专业用药知识，可以咨询专业的医生或者药师，在其指导下合理用药。
