小肠绒毛萎缩可能是饮食不洁、营养不良、溃疡性结肠炎、慢性胃炎、肠梗阻等原因导致，可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗的方式改善。
1、饮食不洁：
考虑是食物不干净的原因导致，使细菌侵入身体，感染胃肠道，破坏肠道内的菌群环境，造成小肠绒毛萎缩。如果病情比较轻微，身体没有明显不适的症状，可以通过改善饮食习惯的方式缓解，比如多吃小米粥、白菜、西红柿等清淡的食物，避免辛辣刺激。
2、营养不良：
可能是婴儿时期摄入营养不足、蛋白质摄入过少、其他疾病耗能过多等原因导致，使患者处于长期营养不良的状态，进而导致小肠绒毛细胞营养吸收不足，发生小肠绒毛萎缩的情况。可在医生的指导下使用复方消化酶胶囊、双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物治疗。
3、溃疡性结肠炎：
可能是家族遗传、免疫因素、气候变化等原因导致，使大肠黏膜及黏膜下层发生慢性的非特异性炎症，炎症刺激小肠绒毛萎缩，引起患者腹痛、腹泻。可遵医嘱使用肠炎宁片、柳氮磺吡啶肠溶片、肠胃宁片等药物治疗。
4、慢性胃炎：
该疾病主要是由于长期吸烟、饮食不当、精神压力大等原因导致，使胃黏膜受到损伤，引发炎症反应，炎症长时间蔓延、刺激可能会导致小肠绒毛发生萎缩，损伤消化系统的功能。可在医生指导下使用埃索美拉唑镁肠溶片、雷贝拉唑钠肠溶片、胶体果胶铋胶囊等药物治疗。
5、肠梗阻：
该疾病考虑是肠粘连、肿瘤、疝气等原因导致，指肠道的内容物不能正常的流通，出现通过障碍，进而导致肠道的蠕动功能丧失，出现肠道梗阻的情况。可在医生的操作下进行肠切除肠吻合术、肠短路吻合术、肠造口或肠外置术等方式治疗。
平时应注意养成良好的生活习惯，戒烟戒酒，保持良好的心情，增加体育锻炼，增强身体的免疫力。
