下面四个方面的进行鉴别:
第一,器质性风湿病,有人认为,纤维肌痛综合征与许多风湿性疾病并存,但是应高避免与所合并的器质性风湿病的漏诊。另外,当类风湿性关节、强制性脊柱炎等这些疾病诊断明确的时候,疼痛就不能单纯的用纤维肌痛来解释;
第二,神经性风湿病,纤维肌痛综合征的患者,疼痛呈刀割样、火烧样的剧痛或是麻木、发紧、针扎样的剧痛,这些疼痛定位比较模糊,变化多端。而且常常与患者的情感、精神紊乱有关系,要与其他的精神性的风湿病相鉴别;
第三,慢性疲劳综合症,慢性疲劳综合症表现疲劳乏力。但是患者没有低热,没有淋巴结肿大等,这是与这两个疾病而鉴别的;
第四,肌筋膜综合征又称为局限性的纤维炎,也是有局部的压痛点,容易与纤维肌痛综合征的压痛点相混。但是肌筋膜综合征的压痛是局部的,有激发点。疼痛会放射到其它的部位,但是纤维肌痛综合征的疼痛是游走性的。