子宫内膜异位症最常见的表现有：
1，下腹痛和痛经，疼痛是内异症的主要症状，典型的表现为继发性的痛经，并且伴有进行性加重，但是有27%-40%的患者她是没有痛经，因此痛经也不是内异症诊断的一个必须标准。
2，不孕，内异症患者不孕率可以高达40%，中、重度的患者可以因为卵巢、输卵管周围的粘连而影响受精卵的运输。
3，性交不适，比较常见于直肠子宫陷凹有异位病灶或者局部有粘连，使子宫的位置后倾固定，在性交时碰撞或者子宫收缩上提而引起疼痛，一般表现为深部的性交痛，在月经来潮前性交痛最为明显。
4，月经异常，15%-30%的患者有经量增多，经期延长，或者月经淋漓不尽，以及经前期点滴状的出血，还有一些其他的特殊症状。在盆腔外任何部位有异位内膜种植生长时，都可能会在局部出现周期性的疼痛，出血和肿块，并且出现一些相应的症状，比如肠道内异症，它可以出现腹痛，腹泻，便秘，或周期性的少量便血。
手术疤痕内异症患者常在剖宫产或会阴侧切术后数月至数年出现一个周期性的瘢痕处疼痛及包块，并且随着时间的延长而加剧。
除了上述以外，还有可能子宫内膜异位的囊肿出现一个扭转或者是破裂而发生急腹痛，多发生于经前期、经后期、性交后或者其它腹压增加的时候。
