首先看一下原发性疾病起病是比较隐秘的，早期缺乏典型的症状，临床症状较明显的病情大约已进入中晚期，本病主要是在肝硬化的基础上发生或者已转移到胃。
1、肝区的疼痛是最常见的症状。
2、肝脏的肿大，肝脏呈进行性增大，质地坚硬，表面凹凸不平。
3、黄疸，一般出现在晚期，多为阻塞性的黄疸，少数为肝细胞性的黄疸。阻塞性的黄疸成因肿瘤压迫，或者侵犯胆管和肝门淋巴结转移，肿大的淋巴结压迫的胆管造成阻塞所致。再一个是肝细胞性的黄疸，主要是由于癌组织肝内广泛的浸润，合并肝硬化慢性肝炎所引起的。
4、再就是肝硬化，肝硬化的征象，在适代偿期肝硬化基础上发生原发性肝癌的患者，常有基础病的临床表现，原有腹水者，可表现为腹水迅速增加，且难治性，腹水一般为漏出液。血性腹水多因肝癌侵犯肝包膜，或者向腹腔内破溃引起的，少数是由腹膜转移癌所引起的。
再有症状就是肝恶性肿瘤的全身表现，是中晚期的主要表现，主要有进行性的消瘦、发热、食欲不振、乏力、营养不良和恶病质等。中晚期还有转移灶的症状，如转移至肺、骨、脑、淋巴结、胸膜等处而产生相应的症状。有时患者以转移灶症状为手法纠正。
再一个就是伴癌综合征，伴癌综合征主要是指原发性肝癌，患者由于本身癌组织代谢异常和癌组织对机体影响，而引起的内分泌和代谢异常，一组症候群，主要表现为自发性的低血糖，红细胞增多症，罕见有高钙血症、高脂血症、类癌综合征等。
