妇科菌群失调在临床上指阴道菌群失调，阴道菌群失调通常用甲硝唑栓、双唑泰栓、乳酸菌阴道胶囊、硝酸咪康唑阴道软胶囊、保妇康栓等药，在使用以上药物时应遵医嘱，不可以盲目用药，若是用药后出现身体不适，一定要及时就医，咨询专业的医生。
1、甲硝唑栓：
阴道菌群失调的发生原因可能与长期滥用抗生素药物有关，也有可能与不注意个人卫生有关，患病之后可以遵医嘱使用甲硝唑栓，用药后可以抑制病原体的生长和繁殖，从而恢复阴道的正常菌群平衡。使用药物期间应避免性生活，以免影响药物发挥作用。
2、双唑泰栓：
该药物属于抗菌药，具有抗滴虫、抗菌等作用，可以治疗外阴阴道假丝酵母菌病、滴虫性阴道炎等多种疾病，在使用此药物期间应避免使用刺激性的洗液，只需要使用温水冲洗阴部即可。
3、乳酸菌阴道胶囊：
本品是由活肠链球菌制成的微生态制剂，主要可以用于治疗由菌群紊乱而引起的阴道病。在使用药物之前需要先清洁外阴，然后将药物放入阴道的深处。
4、硝酸咪康唑阴道软胶囊：
该药物是一种抗真菌药，主要通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥抗菌的作用，进而恢复阴道菌群平衡，在使用药物期间应避免吃辣椒、生姜、芥末等过于刺激的食物。
5、保妇康栓：
该药物主要由莪术油、冰片等中药材组成，具有行气破瘀的功效，也具有生肌止痛的功效，用药后可以改善阴道菌群失调引起的阴部瘙痒、白带增多、白带色黄等症状。需要注意的是未婚女性不宜使用该药物，已婚女性在月经期以及阴道局部有破损的情况下也不宜使用。
用药期间还需要在医生的指导下定期去医院复查，可以了解疾病的治疗效果以便于医生调整用药方案。
