胃全切术后两年咽口水疼考虑是细菌性感冒、咽喉炎、吻合口炎、反流性食管炎、咽喉息肉等原因所致，具体原因要到医院详细检查，然后通过药物、手术等方式治疗。
1、细菌性感冒：
多数患者是因为感染细菌引起，会引发全身炎症反应，表现为打喷嚏、流鼻涕等症状，如果出现上呼吸道感染症状，会引发咽痛。需要遵从医嘱服用盐酸左氧氟沙星片、盐酸环丙沙星片、阿莫西林胶囊等药物治疗。
2、咽喉炎：
此病是因为病原微生物感染引起，受炎症影响，主要表现的咽喉肿痛、咽喉瘙痒等症状，吞咽口水时，可引发局部疼痛。需要遵从医嘱服用阿奇霉素片、罗红霉素胶囊、青霉素V钾片等药物治疗。
3、吻合口炎：
此病是因为胃全切术后，局部炎性渗出所引发的病变，吞咽口水时，可能会影响局部炎症，进而使疼痛感加重。需要遵从医嘱服用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢地尼分散片、头孢克肟颗粒等药物医治。
4、反流性食管炎：
具体病因尚不明确，考虑是长时间吃辛辣刺激性的食物引起，在反酸时，可引发腹部疼痛。应遵从医嘱服用艾司奥美拉唑镁肠溶片、兰索拉唑胶囊、泮托拉唑钠肠溶片等药物治疗。
5、咽喉息肉：
此病是因为局部炎症，长时间刺激引起，会引发咽喉疼痛、咽喉出血等不良反应，吞咽口水可导致咽喉疼痛感加重。可以在专业医生操作下，通过喉镜手术医治。
疾病治疗期间，要适当调整饮食，以清淡食物为主即可，比如鸡蛋羹、八宝粥、燕麦粥等。
