脚掌长跖疣可以通过一般治疗、外用西药、中药洗涤、注射药物、冷冻等方式处理，应及时就医、规范治疗。
1、一般治疗：
脚掌长跖疣主要是由于人乳头瘤病毒感染引起的，一般无特殊的自觉症状，当足部受力时可感觉到疼痛，平时应保持足部的清洁卫生，选择穿鞋底柔软的鞋子，有助于减轻或消除站立或行走私的压痛。
2、外用西药：
可以在医生的指导下外用重组人干扰素α2b凝胶、氟尿嘧啶软膏、水杨酸软膏等药物治疗，能够抑制和杀灭人乳头瘤病毒，且能够促进局部的表皮细胞剥脱，使皮损脱落。
3、中药洗涤：
中医认为脚掌长跖疣多由风热毒邪搏于肌肤而生，常以清热解毒散结治疗为主要原则，可以遵医嘱使用马齿苋、板蓝根、木贼草、白鲜皮等中药煎汤，趁热洗涤患处，有助于去除皮损。
4、注射药物：
主要是遵医嘱使用注射用盐酸博来霉素、注射用盐酸平阳霉素、氟尿嘧啶注射液等药物注射到疣体根部进行治疗，能够使疣体失去活性，达到去除的目的。
5、冷冻：
主要是在疣体上涂抹液氮，利用其低温让跖疣失去活性，然后逐渐的脱落。
脚掌上长跖疣通过积极规范的治疗后，一般愈后良好，但是日常生活中需要避免赤脚在公共场所行走，避免和别人同穿一双鞋袜，以防引起病情复发。
